Genotypic testing on HIV-1 DNA as a tool to assess HIV-1 co-receptor usage in clinical practice: results from the DIVA study group

V. Svicher; C. Alteri; M. Montano; A. Nori; R. D'Arrigo; M. Andreoni; G. Angarano; A. Antinori; G. Antonelli; T. Allice; P. Bagnarelli; F. Baldanti; A. Bertoli; M. Borderi; E. Boeri; I. Bon; B. Bruzzone; R. Barresi; S. Calderisi; A. P. Callegaro; M. R. Capobianchi; F. Gargiulo; F. Castelli; Roberto Cauda; F. Ceccherini-Silberstein; M. Clementi; A. Chirianni; Manuela Colafigli; A. D'Arminio Monforte; A. De Luca; Andrea De Luca; A. Di Biagio; G. Di Nicuolo; G. Di Perri; F. Di Santo; G. Fadda; M. Galli; W. Gennari; V. Ghisetti; A. Costantini; A. Gori; R. Gulminetti; F. Leoncini; G. Maffongelli; F. Maggiolo; R. Maserati; F. Mazzotta; G. Meini; V. Micheli; L. Monno; C. Mussini; S. Nozza; S. Paolucci; G. Palù; S. Parisi; G. Parruti; A. R. Pignataro; T. Quirino; M. C. Re; G. Rizzardini; Maurizio Sanguinetti; Rosaria Santangelo; R. Scaggiante; G. Sterrantino; O. Turriziani; M. L. Vatteroni; C. Viscoli; V. Vullo; M. Zazzi; A. Lazzarin; C. F. Perno

doi:10.1007/s15010-013-0510-3

Genotypic testing on HIV-1 DNA as a tool to assess HIV-1 co-receptor usage in clinical practice: results from the DIVA study group

V. Svicher, C. Alteri, M. Montano, A. Nori, R. D'Arrigo, M. Andreoni, G. Angarano, A. Antinori, G. Antonelli, T. Allice, P. Bagnarelli, F. Baldanti, A. Bertoli, M. Borderi, E. Boeri, I. Bon, B. Bruzzone, R. Barresi, S. Calderisi, A. P. CallegaroM. R. Capobianchi, F. Gargiulo, F. Castelli, Roberto Cauda, F. Ceccherini-Silberstein, M. Clementi, A. Chirianni, Manuela Colafigli, A. D'Arminio Monforte, A. De Luca, Andrea De Luca, A. Di Biagio, G. Di Nicuolo, G. Di Perri, F. Di Santo, G. Fadda, M. Galli, W. Gennari, V. Ghisetti, A. Costantini, A. Gori, R. Gulminetti, F. Leoncini, G. Maffongelli, F. Maggiolo, R. Maserati, F. Mazzotta, G. Meini, V. Micheli, L. Monno, C. Mussini, S. Nozza, S. Paolucci, G. Palù, S. Parisi, G. Parruti, A. R. Pignataro, T. Quirino, M. C. Re, G. Rizzardini, Maurizio Sanguinetti, Rosaria Santangelo, R. Scaggiante, G. Sterrantino, O. Turriziani, M. L. Vatteroni, C. Viscoli, V. Vullo, M. Zazzi, A. Lazzarin, C. F. Perno

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Abstract

We have developed a sequencing assay for determining the usage of the genotypic HIV-1 co-receptor using peripheral blood mononuclear cell (PBMC) DNA in virologically suppressed HIV-1 infected patients. Our specific aims were to (1) evaluate the efficiency of V3 sequences in B versus non-B subtypes, (2) compare the efficiency of V3 sequences and tropism prediction using whole blood and PBMCs for DNA extraction, (3) compare the efficiency of V3 sequences and tropism prediction using a single versus a triplicate round of amplification.

Lingua originale	English
pagine (da-a)	61-71
Numero di pagine	11
Rivista	Infection
Volume	42
DOI	https://doi.org/10.1007/s15010-013-0510-3
Stato di pubblicazione	Pubblicato - 2014

Keywords

HIV1-DNA
genotypic
tropism

OSS delle Nazioni Unite

Questo processo contribuisce al raggiungimento dei seguenti obiettivi di sviluppo sostenibile

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10.1007/s15010-013-0510-3

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Svicher, V., Alteri, C., Montano, M., Nori, A., D'Arrigo, R., Andreoni, M., Angarano, G., Antinori, A., Antonelli, G., Allice, T., Bagnarelli, P., Baldanti, F., Bertoli, A., Borderi, M., Boeri, E., Bon, I., Bruzzone, B., Barresi, R., Calderisi, S., ... Perno, C. F. (2014). Genotypic testing on HIV-1 DNA as a tool to assess HIV-1 co-receptor usage in clinical practice: results from the DIVA study group. Infection, 42, 61-71. https://doi.org/10.1007/s15010-013-0510-3

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PY - 2014

Y1 - 2014

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KW - HIV1-DNA

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UR - http://hdl.handle.net/10807/52366

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DO - 10.1007/s15010-013-0510-3

M3 - Article

SN - 0300-8126

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Genotypic testing on HIV-1 DNA as a tool to assess HIV-1 co-receptor usage in clinical practice: results from the DIVA study group

Abstract

Keywords

OSS delle Nazioni Unite

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