Genotypic testing on HIV-1 DNA as a tool to assess HIV-1 co-receptor usage in clinical practice: results from the DIVA study group

Roberto Cauda, Maurizio Sanguinetti, Rosaria Santangelo, Manuela Colafigli, Andrea De Luca, V. Svicher, C. Alteri, M. Montano, A. Nori, R. D'Arrigo, M. Andreoni, G. Angarano, A. Antinori, G. Antonelli, T. Allice, P. Bagnarelli, F. Baldanti, A. Bertoli, M. Borderi, E. BoeriI. Bon, B. Bruzzone, R. Barresi, S. Calderisi, A. P. Callegaro, M. R. Capobianchi, F. Gargiulo, F. Castelli, F. Ceccherini-Silberstein, M. Clementi, A. Chirianni, A. D'Arminio Monforte, A. De Luca, A. Di Biagio, G. Di Nicuolo, G. Di Perri, F. Di Santo, M. Galli, W. Gennari, V. Ghisetti, A. Costantini, A. Gori, R. Gulminetti, F. Leoncini, G. Maffongelli, F. Maggiolo, R. Maserati, F. Mazzotta, G. Meini, V. Micheli, L. Monno, C. Mussini, S. Nozza, S. Paolucci, G. Palù, S. Parisi, G. Parruti, A. R. Pignataro, T. Quirino, M. C. Re, G. Rizzardini, R. Scaggiante, G. Sterrantino, O. Turriziani, M. L. Vatteroni, C. Viscoli, V. Vullo, M. Zazzi, A. Lazzarin, C. F. Perno

Risultato della ricerca: Contributo in rivistaArticolo in rivistapeer review

9 Citazioni (Scopus)

Abstract

We have developed a sequencing assay for determining the usage of the genotypic HIV-1 co-receptor using peripheral blood mononuclear cell (PBMC) DNA in virologically suppressed HIV-1 infected patients. Our specific aims were to (1) evaluate the efficiency of V3 sequences in B versus non-B subtypes, (2) compare the efficiency of V3 sequences and tropism prediction using whole blood and PBMCs for DNA extraction, (3) compare the efficiency of V3 sequences and tropism prediction using a single versus a triplicate round of amplification.
Lingua originaleEnglish
pagine (da-a)61-71
Numero di pagine11
RivistaInfection
Volume42
DOI
Stato di pubblicazionePubblicato - 2014

Keywords

  • HIV1-DNA
  • genotypic
  • tropism

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