Abstract
| Original language | English |
|---|---|
| Pages (from-to) | 840-860 |
| Number of pages | 21 |
| Journal | Nature Genetics |
| Volume | 53 |
| DOIs | |
| Publication status | Published - 2021 |
UN SDGs
This output contributes to the following UN Sustainable Development Goals (SDGs)
-
SDG 3 Good Health and Well-being
Keywords
- Alleles
- Blood Glucose
- Epigenesis, Genetic
- Gene Expression Profiling
- Genome, Human
- Genome-Wide Association Study
- Glycated Hemoglobin A
- Humans
- Multifactorial Inheritance
- Physical Chromosome Mapping
- Quantitative Trait Loci
- Quantitative Trait, Heritable
- Whites
Fingerprint
Dive into the research topics of 'The trans-ancestral genomic architecture of glycemic traits'. Together they form a unique fingerprint.Cite this
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- Vancouver
}
In: Nature Genetics, Vol. 53, 2021, p. 840-860.
Research output: Contribution to journal › Article
TY - JOUR
T1 - The trans-ancestral genomic architecture of glycemic traits
AU - Chen, Ji
AU - Spracklen, Cassandra N.
AU - Marenne, Gaëlle
AU - Varshney, Arushi
AU - Corbin, Laura J.
AU - Luan, Jian’An
AU - Willems, Sara M.
AU - Wu, Ying
AU - Zhang, Xiaoshuai
AU - Horikoshi, Momoko
AU - Boutin, Thibaud S.
AU - Mägi, Reedik
AU - Waage, Johannes
AU - Li-Gao, Ruifang
AU - Chan, Kei Hang Katie
AU - Yao, Jie
AU - Anasanti, Mila D.
AU - Chu, Audrey Y.
AU - Claringbould, Annique
AU - Heikkinen, Jani
AU - Hong, Jaeyoung
AU - Hottenga, Jouke-Jan
AU - Huo, Shaofeng
AU - Kaakinen, Marika A.
AU - Louie, Tin
AU - März, Winfried
AU - Moreno-Macias, Hortensia
AU - Ndungu, Anne
AU - Nelson, Sarah C.
AU - Nolte, Ilja M.
AU - North, Kari E.
AU - Raulerson, Chelsea K.
AU - Ray, Debashree
AU - Rohde, Rebecca
AU - Rybin, Denis
AU - Schurmann, Claudia
AU - Sim, Xueling
AU - Southam, Lorraine
AU - Stewart, Isobel D.
AU - Wang, Carol A.
AU - Wang, Yujie
AU - Wu, Peitao
AU - Zhang, Weihua
AU - Ahluwalia, Tarunveer S.
AU - Appel, Emil V. R.
AU - Bielak, Lawrence F.
AU - Brody, Jennifer A.
AU - Burtt, Noël P.
AU - Cabrera, Claudia P.
AU - Cade, Brian E.
AU - Chai, Jin Fang
AU - Chai, Xiaoran
AU - Chang, Li-Ching
AU - Chen, Chien-Hsiun
AU - Chen, Brian H.
AU - Chitrala, Kumaraswamy Naidu
AU - Chiu, Yen-Feng
AU - De Haan, Hugoline G.
AU - Delgado, Graciela E.
AU - Demirkan, Ayse
AU - Duan, Qing
AU - Engmann, Jorgen
AU - Fatumo, Segun A.
AU - Gayán, Javier
AU - Giulianini, Franco
AU - Gong, Jung Ho
AU - Gustafsson, Stefan
AU - Hai, Yang
AU - Hartwig, Fernando P.
AU - He, Jing
AU - Heianza, Yoriko
AU - Huang, Tao
AU - Huerta-Chagoya, Alicia
AU - Hwang, Mi Yeong
AU - Jensen, Richard A.
AU - Kawaguchi, Takahisa
AU - Kentistou, Katherine A.
AU - Kim, Young Jin
AU - Kleber, Marcus E.
AU - Kooner, Ishminder K.
AU - Lai, Shuiqing
AU - Lange, Leslie A.
AU - Langefeld, Carl D.
AU - Lauzon, Marie
AU - Li, Man
AU - Ligthart, Symen
AU - Liu, Jun
AU - Loh, Marie
AU - Long, Jirong
AU - Lyssenko, Valeriya
AU - Mangino, Massimo
AU - Marzi, Carola
AU - Montasser, May E.
AU - Nag, Abhishek
AU - Nakatochi, Masahiro
AU - Noce, Damia
AU - Noordam, Raymond
AU - Pistis, Giorgio
AU - Preuss, Michael
AU - Raffield, Laura
AU - Rasmussen-Torvik, Laura J.
AU - Rich, Stephen S.
AU - Robertson, Neil R.
AU - Rueedi, Rico
AU - Ryan, Kathleen
AU - Sanna, Serena
AU - Saxena, Richa
AU - Schraut, Katharina E.
AU - Sennblad, Bengt
AU - Setoh, Kazuya
AU - Smith, Albert V.
AU - Sparsø, Thomas
AU - Strawbridge, Rona J.
AU - Takeuchi, Fumihiko
AU - Tan, Jingyi
AU - Trompet, Stella
AU - Van Den Akker, Erik
AU - Van Der Most, Peter J.
AU - Verweij, Niek
AU - Vogel, Mandy
AU - Wang, Heming
AU - Wang, Chaolong
AU - Wang, Nan
AU - Warren, Helen R.
AU - Wen, Wanqing
AU - Wilsgaard, Tom
AU - Wong, Andrew
AU - Wood, Andrew R.
AU - Xie, Tian
AU - Zafarmand, Mohammad Hadi
AU - Zhao, Jing-Hua
AU - Zhao, Wei
AU - Amin, Najaf
AU - Arzumanyan, Zorayr
AU - Astrup, Arne
AU - Bakker, Stephan J. L.
AU - Baldassarre, Damiano
AU - Beekman, Marian
AU - Bergman, Richard N.
AU - Bertoni, Alain
AU - Blüher, Matthias
AU - Bonnycastle, Lori L.
AU - Bornstein, Stefan R.
AU - Bowden, Donald W.
AU - Cai, Qiuyin
AU - Campbell, Archie
AU - Campbell, Harry
AU - Chang, Yi Cheng
AU - De Geus, Eco J. C.
AU - Dehghan, Abbas
AU - Du, Shufa
AU - Eiriksdottir, Gudny
AU - Farmaki, Aliki Eleni
AU - Frånberg, Mattias
AU - Fuchsberger, Christian
AU - Gao, Yutang
AU - Gjesing, Anette P.
AU - Goel, Anuj
AU - Han, Sohee
AU - Hartman, Catharina A.
AU - Herder, Christian
AU - Hicks, Andrew A.
AU - Hsieh, Chang-Hsun
AU - Hsueh, Willa A.
AU - Ichihara, Sahoko
AU - Igase, Michiya
AU - Ikram, M. Arfan
AU - Johnson, W. Craig
AU - Jørgensen, Marit E.
AU - Joshi, Peter K.
AU - Kalyani, Rita R.
AU - Kandeel, Fouad R.
AU - Katsuya, Tomohiro
AU - Khor, Chiea Chuen
AU - Kiess, Wieland
AU - Kolcic, Ivana
AU - Kuulasmaa, Teemu
AU - Kuusisto, Johanna
AU - Läll, Kristi
AU - Lam, Kelvin
AU - Lawlor, Deborah A.
AU - Lee, Nanette R.
AU - Lemaitre, Rozenn N.
AU - Li, Honglan
AU - Lin, Shih-Yi
AU - Lindström, Jaana
AU - Linneberg, Allan
AU - Liu, Jianjun
AU - Lorenzo, Carlos
AU - Matsubara, Tatsuaki
AU - Matsuda, Fumihiko
AU - Mingrone, Geltrude
AU - Mooijaart, Simon
AU - Moon, Sanghoon
AU - Nabika, Toru
AU - Nadkarni, Girish N.
AU - Nadler, Jerry L.
AU - Nelis, Mari
AU - Neville, Matt J.
AU - Norris, Jill M.
AU - Ohyagi, Yasumasa
AU - Peters, Annette
AU - Peyser, Patricia A.
AU - Polasek, Ozren
AU - Qi, Qibin
AU - Raven, Dennis
AU - Reilly, Dermot F.
AU - Reiner, Alex
AU - Rivideneira, Fernando
AU - Roll, Kathryn
AU - Rudan, Igor
AU - Sabanayagam, Charumathi
AU - Sandow, Kevin
AU - Sattar, Naveed
AU - Schürmann, Annette
AU - Shi, Jinxiu
AU - Stringham, Heather M.
AU - Taylor, Kent D.
AU - Teslovich, Tanya M.
AU - Thuesen, Betina
AU - Timmers, Paul R. H. J.
AU - Tremoli, Elena
AU - Tsai, Michael Y.
AU - Uitterlinden, Andre
AU - Van Dam, Rob M.
AU - Van Heemst, Diana
AU - Van Hylckama Vlieg, Astrid
AU - Van Vliet-Ostaptchouk, Jana V.
AU - Vangipurapu, Jagadish
AU - Vestergaard, Henrik
AU - Wang, Tao
AU - Willems Van Dijk, Ko
AU - Zemunik, Tatijana
AU - Abecasis, Gonçalo R.
AU - Adair, Linda S.
AU - Aguilar-Salinas, Carlos Alberto
AU - Alarcón-Riquelme, Marta E.
AU - An, Ping
AU - Aviles-Santa, Larissa
AU - Becker, Diane M.
AU - Beilin, Lawrence J.
AU - Bergmann, Sven
AU - Bisgaard, Hans
AU - Black, Corri
AU - Boehnke, Michael
AU - Boerwinkle, Eric
AU - Böhm, Bernhard O.
AU - Bønnelykke, Klaus
AU - Boomsma, D. I.
AU - Bottinger, Erwin P.
AU - Buchanan, Thomas A.
AU - Canouil, Mickaël
AU - Caulfield, Mark J.
AU - Chambers, John C.
AU - Chasman, Daniel I.
AU - Chen, Yii-Der Ida
AU - Cheng, Ching-Yu
AU - Collins, Francis S.
AU - Correa, Adolfo
AU - Cucca, Francesco
AU - De Silva, H. Janaka
AU - Dedoussis, George
AU - Elmståhl, Sölve
AU - Evans, Michele K.
AU - Ferrannini, Ele
AU - Ferrucci, Luigi
AU - Florez, Jose C.
AU - Franks, Paul W.
AU - Frayling, Timothy M.
AU - Froguel, Philippe
AU - Gigante, Bruna
AU - Goodarzi, Mark O.
AU - Gordon-Larsen, Penny
AU - Grallert, Harald
AU - Grarup, Niels
AU - Grimsgaard, Sameline
AU - Groop, Leif
AU - Gudnason, Vilmundur
AU - Guo, Xiuqing
AU - Hamsten, Anders
AU - Hansen, Torben
AU - Hayward, Caroline
AU - Heckbert, Susan R.
AU - Horta, Bernardo L.
AU - Huang, Wei
AU - Ingelsson, Erik
AU - James, Pankow S.
AU - Jarvelin, Marjo-Ritta
AU - Jonas, Jost B.
AU - Jukema, J. Wouter
AU - Kaleebu, Pontiano
AU - Kaplan, Robert
AU - Kardia, Sharon L. R.
AU - Kato, Norihiro
AU - Keinanen-Kiukaanniemi, Sirkka M.
AU - Kim, Bong-Jo
AU - Kivimaki, Mika
AU - Koistinen, Heikki A.
AU - Kooner, Jaspal S.
AU - Körner, Antje
AU - Kovacs, Peter
AU - Kuh, Diana
AU - Kumari, Meena
AU - Kutalik, Zoltan
AU - Laakso, Markku
AU - Lakka, Timo A.
AU - Launer, Lenore J.
AU - Leander, Karin
AU - Li, Huaixing
AU - Lin, Xu
AU - Lind, Lars
AU - Lindgren, Cecilia
AU - Liu, Simin
AU - Loos, Ruth J. F.
AU - Magnusson, Patrik K. E.
AU - Mahajan, Anubha
AU - Metspalu, Andres
AU - Mook-Kanamori, Dennis O.
AU - Mori, Trevor A.
AU - Munroe, Patricia B.
AU - Njølstad, Inger
AU - O’Connell, Jeffrey R.
AU - Oldehinkel, Albertine J.
AU - Ong, Ken K.
AU - Padmanabhan, Sandosh
AU - Palmer, Colin N. A.
AU - Palmer, Nicholette D.
AU - Pedersen, Oluf
AU - Pennell, Craig E.
AU - Porteous, David J.
AU - Pramstaller, Peter P.
AU - Province, Michael A.
AU - Psaty, Bruce M.
AU - Qi, Lu
AU - Raffel, Leslie J.
AU - Rauramaa, Rainer
AU - Redline, Susan
AU - Ridker, Paul M.
AU - Rosendaal, Frits R.
AU - Saaristo, Timo E.
AU - Sandhu, Manjinder
AU - Saramies, Jouko
AU - Schneiderman, Neil
AU - Schwarz, Peter
AU - Scott, Laura J.
AU - Selvin, Elizabeth
AU - Sever, Peter
AU - Shu, Xiao-Ou
AU - Slagboom, P. Eline
AU - Small, Kerrin S.
AU - Smith, Blair H.
AU - Snieder, Harold
AU - Sofer, Tamar
AU - Sørensen, Thorkild I. A.
AU - Spector, Tim D.
AU - Stanton, Alice
AU - Steves, Claire J.
AU - Stumvoll, Michael
AU - Sun, Liang
AU - Tabara, Yasuharu
AU - Tai, E. Shyong
AU - Timpson, Nicholas J.
AU - Tönjes, Anke
AU - Tuomilehto, Jaakko
AU - Tusie, Teresa
AU - Uusitupa, Matti
AU - Van Der Harst, Pim
AU - Van Duijn, Cornelia
AU - Vitart, Veronique
AU - Vollenweider, Peter
AU - Vrijkotte, Tanja G. M.
AU - Wagenknecht, Lynne E.
AU - Walker, Mark
AU - Wang, Ya X.
AU - Wareham, Nick J.
AU - Watanabe, Richard M.
AU - Watkins, Hugh
AU - Wei, Wen B.
AU - Wickremasinghe, Ananda R.
AU - Willemsen, Gonneke
AU - Wilson, James F.
AU - Wong, Tien-Yin
AU - Wu, Jer-Yuarn
AU - Xiang, Anny H.
AU - Yanek, Lisa R.
AU - Yengo, Loïc
AU - Yokota, Mitsuhiro
AU - Zeggini, Eleftheria
AU - Zheng, Wei
AU - Zonderman, Alan B.
AU - Rotter, Jerome I.
AU - Gloyn, Anna L.
AU - Mccarthy, Mark I.
AU - Dupuis, Josée
AU - Meigs, James B.
AU - Scott, Robert A.
AU - Prokopenko, Inga
AU - Leong, Aaron
AU - Liu, Ching-Ti
AU - Parker, Stephen C. J.
AU - Mohlke, Karen L.
AU - Langenberg, Claudia
AU - Wheeler, Eleanor
AU - Morris, Andrew P.
AU - Barroso, Inês
AU - De Haan, Hugoline G.
AU - Van Den Akker, Erik
AU - Van Der Most, Peter J.
AU - De Geus, Eco J. C.
AU - Van Dam, Rob M.
AU - Van Heemst, Diana
AU - Van Hylckama Vlieg, Astrid
AU - Van Willems Van Dijk, Ko
AU - De Silva, H. Janaka
AU - Van Der Harst, Pim
AU - Van Duijn, Cornelia
PY - 2021
Y1 - 2021
N2 - Glycemic traits are used to diagnose and monitor type 2 diabetes and cardiometabolic health. To date, most genetic studies of glycemic traits have focused on individuals of European ancestry. Here we aggregated genome-wide association studies comprising up to 281,416 individuals without diabetes (30% non-European ancestry) for whom fasting glucose, 2-h glucose after an oral glucose challenge, glycated hemoglobin and fasting insulin data were available. Trans-ancestry and single-ancestry meta-analyses identified 242 loci (99 novel; P < 5 × 10−8), 80% of which had no significant evidence of between-ancestry heterogeneity. Analyses restricted to individuals of European ancestry with equivalent sample size would have led to 24 fewer new loci. Compared with single-ancestry analyses, equivalent-sized trans-ancestry fine-mapping reduced the number of estimated variants in 99% credible sets by a median of 37.5%. Genomic-feature, gene-expression and gene-set analyses revealed distinct biological signatures for each trait, highlighting different underlying biological pathways. Our results increase our understanding of diabetes pathophysiology by using trans-ancestry studies for improved power and resolution.
AB - Glycemic traits are used to diagnose and monitor type 2 diabetes and cardiometabolic health. To date, most genetic studies of glycemic traits have focused on individuals of European ancestry. Here we aggregated genome-wide association studies comprising up to 281,416 individuals without diabetes (30% non-European ancestry) for whom fasting glucose, 2-h glucose after an oral glucose challenge, glycated hemoglobin and fasting insulin data were available. Trans-ancestry and single-ancestry meta-analyses identified 242 loci (99 novel; P < 5 × 10−8), 80% of which had no significant evidence of between-ancestry heterogeneity. Analyses restricted to individuals of European ancestry with equivalent sample size would have led to 24 fewer new loci. Compared with single-ancestry analyses, equivalent-sized trans-ancestry fine-mapping reduced the number of estimated variants in 99% credible sets by a median of 37.5%. Genomic-feature, gene-expression and gene-set analyses revealed distinct biological signatures for each trait, highlighting different underlying biological pathways. Our results increase our understanding of diabetes pathophysiology by using trans-ancestry studies for improved power and resolution.
KW - Alleles
KW - Blood Glucose
KW - Epigenesis, Genetic
KW - Gene Expression Profiling
KW - Genome, Human
KW - Genome-Wide Association Study
KW - Glycated Hemoglobin A
KW - Humans
KW - Multifactorial Inheritance
KW - Physical Chromosome Mapping
KW - Quantitative Trait Loci
KW - Quantitative Trait, Heritable
KW - Whites
KW - Alleles
KW - Blood Glucose
KW - Epigenesis, Genetic
KW - Gene Expression Profiling
KW - Genome, Human
KW - Genome-Wide Association Study
KW - Glycated Hemoglobin A
KW - Humans
KW - Multifactorial Inheritance
KW - Physical Chromosome Mapping
KW - Quantitative Trait Loci
KW - Quantitative Trait, Heritable
KW - Whites
UR - http://hdl.handle.net/10807/200871
U2 - 10.1038/s41588-021-00852-9
DO - 10.1038/s41588-021-00852-9
M3 - Article
SN - 1061-4036
VL - 53
SP - 840
EP - 860
JO - Nature Genetics
JF - Nature Genetics
ER -